Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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