Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC006457.1-201ENST00000420733 392 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RPL12P32-201ENST00000484010 494 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PPP1R1AP1-201ENST00000525622 425 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CU634019.6-201ENST00000623165 710 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 METTL2A-204ENST00000616852 3150 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SNPHO15079 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 UTP23-201ENST00000309822 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC093392.1-201ENST00000366280 340 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC019181.1-201ENST00000417151 310 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 NEFLP1-201ENST00000436364 984 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC009022.1-201ENST00000472115 496 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 RN7SL65P-201ENST00000485221 315 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 AC079795.1-201ENST00000508847 358 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SNPHO15079 KRT18P54-201ENST00000513396 748 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms