Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RFXAPO00287 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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