Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
GTF3C6Q969F1 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms