Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
VPS72Q15906 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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