Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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SYCP1Q15431 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SYCP1Q15431 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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