Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms