Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHAF1AQ13111 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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