Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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IFT88Q13099 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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