Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms