Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CTDSPL2Q05D32 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms