Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRGP23470 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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