Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRBP23467 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRBP23467 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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