Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms