Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
GTF3C6Q969F1 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms