Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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