Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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