Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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BRD3Q15059 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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BRD3Q15059 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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BRD3Q15059 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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BRD3Q15059 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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BRD3Q15059 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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