Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NWD1Q149M9 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms