Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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RAB39AQ14964 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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RAB39AQ14964 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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RAB39AQ14964 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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RAB39AQ14964 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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RAB39AQ14964 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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RAB39AQ14964 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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RAB39AQ14964 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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RAB39AQ14964 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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