Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CNGB1Q14028 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CNGB1Q14028 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms