Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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