Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP1A4Q13733 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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