Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms