Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TCOF1Q13428 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TCOF1Q13428 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TCOF1Q13428 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TCOF1Q13428 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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TCOF1Q13428 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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