Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NME3Q13232 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NME3Q13232 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NME3Q13232 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NME3Q13232 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NME3Q13232 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NME3Q13232 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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