Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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IFT88Q13099 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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IFT88Q13099 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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IFT88Q13099 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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