Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GRIK2Q13002 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms