Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 NLRP5-203ENST00000621651 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 CHRDL1-203ENST00000394797 2413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 AC000036.1-201ENST00000449652 2030 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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