Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPN13Q12923 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPN13Q12923 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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