Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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