Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
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PTPRMP28827 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRMP28827 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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