Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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