Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms