Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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