Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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SGCBQ16585 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SGCBQ16585 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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