Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAM2Q15035 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms