Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDH18Q13634 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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