Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4BQ13620 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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