Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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