Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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FOXE3Q13461 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXE3Q13461 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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