Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TCOF1Q13428 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TCOF1Q13428 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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