Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CHAF1BQ13112 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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