Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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GPS1Q13098 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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GPS1Q13098 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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GPS1Q13098 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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