Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
MKRN3Q13064 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TRPS1-208ENST00000519076 3329 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN3Q13064 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
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