Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRMP28827 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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