Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPREP23469 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPREP23469 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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