Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBXN7O94888 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms