Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms