Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LTV1Q96GA3 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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